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Fix bugs in NBRF parsing where not all of the comments were passed through. Try to speed up sequence building using joins instead of sequential addition of sequence.
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>DL;804Angiostrongylus_cantonensis
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--------------------------------------------------
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----------------------------------ATT-AAGCCATG-CA-
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T-GAG-GA--GTTC-A--GC------TT--TA-A----G-T-GA--AA-C
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-TGCGAACGGCTCATTAG-AGCAGATG-T-GATT---TATT-CG--G--A
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A-A--A-T--CC-T----ATT-GGA--TAACTGCG--GTAAT-TCTGGAG
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CTAATACATGCGTAT-A-A-AC-CCTG-AC---T--T-T--C---GAAA-
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-GGGTGCAAT-TA-TTAGAG---C---AA-A-TCAAT-CAT---------
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----T-T---TC----------G-GA------TG----TAGTT-------
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---T---GCT---G-A-C-TC-TGAATA-A---CG--CAG--CATA-TCG
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G-CGGC-T-T-GT---TCGCCGATAAT-CCGAAAA----AG---TGT-C-
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TGCCC-TATCA--AC---CT---GA-TGGTAGTCTATTAGTCTA-CCATG
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GTTATTACGGGTAACGGAGAATAAGGGTT-CGACTCCGGAGAGGGAGCCT
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TAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAG-GCGCGAAACTTATCC
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AA-T-CTTG-----A-ATAGATGA-GATAGTGACT---------------
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--------AAAAATAAAAA--GACCA---TTCC-T-AT-G--GAACG-GT
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TATTTCAATGAGT--TGATCATAAACCTTTTTT--C-G-AGTA--TCCAG
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TGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTC--CACTA
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GTGTA-AATCGTCATTGCTGCGGTTAAAAAGC-TCGTAGTTGGAT-C-TG
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AGTTGC---AT--GCA-AT-G-ATTCG--C-CT----T--TG--G--CGT
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----TAAT------C---AT-TG-TTGTG---ACTA---T------T-T-
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--G--CTG--G-T-T--TTCT-AT--TG-A--AA-----TTTC-----G-
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A-TT-----TCTTTA-GTG-GC-TA--GCGA-GTT-TA-CTTTGA-AT-A
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AATTAAAGTGCT-CAGAACAAG---CGTT-----T--GC-TT-G--AAT-
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G-GTCGAT-CATGGAATAA-----TAAAAGAGGAC--TTCG---GT-T--
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----CTATT-T----ATTGGTTC-AG---G-AA------CTG------AA
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GT-AATGATTAAGAGGGACA--ATTC-GGGGGCATTCGTATCCCTGCGCG
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AGAGGTGAAATTCGTG-GACCG-CAGGGGGACGCCCTAAAGCGAAAG-CA
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TTTGCC-AAGAAT--GTCTTCATTAATCA-AGAACGAAAGTCAGAGGTTC
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GAAGGCGATTAGATA--CCGCCC-TAGTTCTGACCGTAAACTATGCCATC
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TAGC-GA--TCC-GAT--GG-GG--TA--T--TG--T-T----GCCTT--
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GTCGAGG-AGCTT-CCCGGAAACGA--AA-GTCTTTCGGT-TCCTGGGGT
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AGTATGGTTGC-AAAGCT-G-AAACTTAAAGA-AATTGACGGAATGGCAC
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CACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGA--AAACT
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-CACCC-GGCCCGGACACCGTAA-GGATTGAC-----AGATTGA--A---
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AGCTCTTTCTC-GATTTGGTGGTTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTG-
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GTGGAG-CGATTTGTCTGGTTTATTCC-GAT-AACGAGCGAGACTCT-AG
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-C-C--TG-CTAAA-TA-G--TGA--CTA---------------GA----
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TT-----------AT------T----GAGTC-------TA-G----T--C
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-------TA-------------C-TT-----CTT-AG---AGGGATAAG-
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CGG---TGTT-T-----A-G-C--CGCA--CG-AGATTGAGCGATAACAG
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GTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCGGGG-CTG-CACGCGCGCTACAATGGA
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AG-AAT-CAGC--TGGC---CTA--T----CCAT-TGC-CG-A-AAGGT-
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AT----T----GGTAAACCG-TTGAAACT--CTTCC-GTG-ACCGGGATA
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GGGAATTGT--A-ATT---------ATT---TCCC-TTGAACG-AGGAAT
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TCCTAGTAAGTGTG-AGTCATCAGCTCACGCTGATTACGTCCC-TGCCAT
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TTGTACACACCGCCCGTCGCTGTC-CGGG-ACTG--AGC-TGTC--TCGA
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GAGGACT-GCGG-A-CTA----CT--GTA----TTGA-GG---CCT----
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---T---CGGG------TCG-----CGATA----TGGCG---GG-AAA-C
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AG-TTC-AATC-G-CAATG-G--CTTGAACCGGGTAAAAGTCGT-AACAA
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GGTATCTG------------------------------------------
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---------------------------
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*
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>DL;815Parelaphostrongylus_odocoil
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--------------------------------------------------
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----------------------------------ATT-AAGCCATG-CA-
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T-GTG-GA--GTTC-A--AC------TT--CA-A---AG-T-GA--AA-C
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-TGCGAACGGCTCATTAG-AGCAGATG-T-CATT---TATT-CG--G--A
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A-A--A-T--CC-T--T-AAT-GGA--TAACTGCG--GTAAT-TCTGGAG
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CTAATACATATGCAT-A-A-AC-CCTG-AC---T--C-TG-T---GAAA-
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-GGGTGCAAT-TA-TTAGAG---C---AA-A-TCAAT-CAT---------
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----T-T---TC----------G-GA------TG----TAGTT-------
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---T---GCT---G-A-C-TC-TGAATA-A---CG--CAG--CATA-TCG
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G-CGGC-T-T-GT---TCGCCGATATT-CCGAAAA----AG---TGT-C-
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TGCCC-TATCA--AC---CT---GA-TGGTAGTCTATTAGTCTA-CCATG
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GTTATTACGGGTAACGGAGAATAAGGGTT-CGACTCCGGAGAGGGAGCCT
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TAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAG-GCGCGAAACTTATCC
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AA-T-CTTG-----A-ATAGATGA-GATAGTGACT---------------
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--------AAAAATAAAAA--GACCA---TTCC-T-AT-G--GAACG-GT
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CATTTCAATGAGT--TGATCATAAACCTTTTTT--C-G-AGTA--TCAAG
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TGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTC--CACTA
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GTGTA-AATCGTCATTGCTGCGGTTAAAAAGC-TCGTAGTTGGAT-C-TG
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AGTCGC---AT--GCA-AT-G-ATTCG--C-CT----T--TG--G--CGT
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----TAAT------C---AT-TG-TTGTG---ACTA---T------T-T-
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--G--CTG--G-T-T--TTCT-AT--TG-A--AA-----TTTC-----G-
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A-TT-----TCTATA-GTG-GC-TA--GCGA-GTT-TA-CTTTGA-AT-A
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AATTAAAGTGCT-CAGAACAAG---CGTT-----T--GC-TT-G--AAT-
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G-GTCGAT-CATGGAATAA-----TAAAAGAGGAC--TTCG---GT-T--
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----CTATT-T----ATTGGTTC-AG---G-AA------CTG------AA
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AT-AATGGTTAAGAGGGACA--ATTC-GGGGGCATTCGTATCCCTGCGCG
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AGAGGTGAAATTCGTG-GACCG-CAGGGGGACGCCCTAAAGCGAAAG-CA
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TTTGCC-AAGAAT--GTCTTCATTAATCA-AGAACGAAAGTCAGAGGTTC
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GAAGGCGATTAGATA--CCGCCC-TAGTTCTGACCGTAAACTATGCCATC
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TAGC-GA--TCC-GAT--GG-GG--TA--T--TG--T-T----GCCTT--
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GTCGAGG-AGCTT-CCCGGAAACGA--AA-GTCTTTCGGT-TCCTGGGGT
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AGTATGGTTGC-AAAGCT-G-AAACTTAAAGA-AATTGACGGAATGGCAC
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CACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGA--AAACT
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-CACCC-GGCCCGGACACCGTAA-GGATTGAC-----AGATTGA--A---
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AGCTCTTTCTC-GATTTGGTGGTTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTG-
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GTGGAG-CGATTTGTCTGGTTTATTCC-GAT-AACGAGCGAGACTCT-AG
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-C-C--TG-CTAAA-TA-G--TGA--CTA---------------GA----
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T------------ACG-----T----ATGTC-------TA-G----T--C
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-------TA-------------C-TT-----CTT-AG---AGGGATAAG-
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CGG---TGTT-T-----A-G-C--CGCA--CG-AGATTGAGCGATAACAG
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GTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGG-CTG-CACGCGCGCTACAATGGA
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AG-AAT-CAGC--TGGC---CTA--T----CCAT-TAC-CG-A-AAGGT-
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AT----T----GGTAAACCG-TTGAAACT--CTTCC-GTG-ACCGGGATA
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GGGAATTGT--A-ATT---------ATT---TCCC-TTGAACG-AGGAAT
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TCCTAGTAAGTGTG-AGTCATCAGCTCACGCTGATTACGTCCC-TGCCAT
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TTGTACACACCGCCCGTCGCTGTC-CGGG-ACTG--AGC-TGTC--TCGA
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GAGGACT-GCGG-A-CTA----CT--GTA----TTGA-GG---CCT----
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---T---CGGG------TCG-----CGATA----TGGCG---GG-AAA-C
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AG-TTC-AATC-G-CAATG-G--CTTGAACCGGGTAAAAGTCGT-A----
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