Command line: [exonerate -m protein2genome gene026_baits.fasta gene026_contigs.fasta --showcigar no --showvulgar no --bestn 2 --refine full]
Hostname: [RBGs-MacBook-Air.local]

C4 Alignment:
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         Query: Morus-gene026
        Target: NODE_2_length_1708_cov_48.590765 SPAdes NODE_2 contig:[revcomp]
         Model: protein2genome:local
     Raw score: 1308
   Query range: 69 -> 441
  Target range: 1416 -> 331

   70 : ProGluSerProTrpThrCysSerProLeuGlnThr<-><->ProSerProSerLeuLeuTy :   88
        |||||||||||||||||| !!|||||||||||||||      ! !|||||||||||||||||
        ProGluSerProTrpThrSerSerProLeuGlnThrLeuSerHisSerProSerLeuLeuTy
 1416 : CCAGAGTCGCCATGGACCAGCTCACCCCTCCAGACCCTTTCCCATTCCCCTTCCCTCCTCTA : 1356

   89 : rHisCysIleAlaSerLeuHisArgHisAspGlyThrIleHisSerIleAlaValSerAsnG :  109
        |||||||||||||||||||!.!||||||||||||||||||:!!|||||||||..!|||||||
        rHisCysIleAlaSerLeuArgArgHisAspGlyThrIleTyrSerIleAlaThrSerAsnG
 1355 : CCACTGCATCGCCTCGCTCCGCCGTCACGATGGCACTATCTACTCCATCGCCACCTCAAACG : 1293

  110 : lyValValPheThrGlySerAspSerArgArgIleArgAlaTrpArgGlnProAspCysThr :  129
        ||||||||||||||||||||!  |||||||||:!!||||||||||||||| !!||||||!:!
        lyValValPheThrGlySerGlySerArgArgValArgAlaTrpArgGlnAlaAspCysSer
 1292 : GCGTCGTCTTTACTGGCTCCGGGAGCCGCCGCGTCCGGGCATGGCGTCAAGCTGATTGCAGC : 1233

  130 : GluArgGlyLeuLeuLysAlaLysPheGlyGluValArgAlaIleLeuAlaHisGlyAspTh :  150
        |||!.!||||||||||||||||||! !|||..!||||||||||||||||||! !||||||||
        GluHisGlyLeuLeuLysAlaLysCysGlyArgValArgAlaIleLeuAlaLeuGlyAspTh
 1232 : GAGCATGGGCTTCTCAAAGCCAAGTGTGGCCGGGTCAGAGCAATCTTAGCCCTTGGAGACAC : 1170

  151 : rLeuPheThrCysHisLysAspAsnLysIleArgValTrpAsnPheAsnAsnPheAlaSerP :  171
        ||||||||||! !|||!!.|||||||||||||||!.!||||||                !!!
        rLeuPheThrSerHisAsnAspAsnLysIleArgAlaTrpAsn---------------ArgT
 1169 : TCTCTTCACGTCCCACAACGACAACAAAATCCGAGCCTGGAAT---------------CGTT : 1122

  172 : heLysLysValCysSerPheProArgThrSerSerLeuSerPheSerThrLeuPheSerArg :  191
        :!:!!|||! !||||||.!!|||||||||:!!|||!!!! !!  ! !:!!||||||||||||
        yrGlnLysGlyCysSerIleProArgThrAlaSerPheMetSerPheSerLeuPheSerArg
 1121 : ATCAAAAAGGTTGTTCCATTCCGAGAACGGCCTCGTTCATGTCGTTTTCTTTGTTCTCGAGA : 1062

  192 : AlaLysAsnAspAlaLysArgAsnHisLysGluCysValSerCysLeuAlaTyrTyrHisAl :  212
        ||||||:!!|||   :!!|||.!.|||||||||||||||||||||:!!||||||||||||||
        AlaLysHisAsp---GluArgGlnHisLysGluCysValSerCysMetAlaTyrTyrHisAl
 1061 : GCCAAGCACGAT---GAACGACAGCACAAGGAGTGCGTTTCATGCATGGCGTATTACCACGC : 1002

  213 : aGluGlyIleLeuTyrThrGlySerHisAspArgThrValLysAlaTrpArgValSerSerG :  233
        |||||||||||||||||||!.!! !:!!:!!|||||||||:!!!.!|||||||||||||||!
        aGluGlyIleLeuTyrThrAlaTyrTyrAsnArgThrValGlnValTrpArgValSerSerG
 1001 : AGAAGGGATTCTATACACGGCCTATTACAATAGGACGGTCCAAGTTTGGCGAGTGTCGAGTG :  939

  234 : lyLysCysValAspSerPheLeuAlaHisGluAspLysValAsnAspIleLeuValAsnGln :  253
         !|||||||||||||||||||||||||||||||||! !||||||!  |||||||||||| !!
        luLysCysValAspSerPheLeuAlaHisGluAspIleValAsnAlaIleLeuValAsn***
  938 : AAAAATGCGTTGACTCGTTCTTGGCTCACGAGGACATAGTCAATGCGATACTGGTCAACTAA :  879

  254 : GluAspGlyCysValPheThrCysSerSerAspGlySerValLysIleTrpArgArgIleTy :  274
        ! !:!!|||  !|||||||||||||||! !|||||||||||||||||||||!:!|||||| !
        GlyAsnGlyAspValPheThrCysSerLeuAspGlySerValLysIleTrpLysArgIleAs
  878 : GGGAACGGCGATGTGTTTACTTGCTCATTGGACGGCTCTGTAAAGATCTGGAAAAGGATCAA :  816

  275 : rArgAspAsnSerTyrThrLeuThrMetIleLeuArgPheGlnProSerProValAsnAlaI :  295
        !|||!!:||||||  !||||||||||||! !||||||! !||||||||||||||||||.!!|
        nArgGluAsnSerArgThrLeuThrMetThrLeuArgCysGlnProSerProValAsnThrI
  815 : TAGAGAGAACTCCCGCACCCTAACGATGACACTCAGATGCCAACCTTCTCCTGTGAACACCA :  753

  296 : leAlaLeuSerLeuSerSerSerSerSerSerSerThrSerSerSerSerThrSerSerPro :  315
        ||||||||         ||||||  !|||||||||:!!||||||||||||:!!|||||| !!
        leAlaLeu---------SerSerValSerSerSerSerSerSerSerSerSerSerSerSer
  752 : TAGCTTTA---------AGCTCAGTGTCCTCATCTTCTTCCTCTTCCTCTTCGTCTTCTTCG :  702

  316 : PheThrPheGlySerGlyPheLeuTyrSerGlySerSerAspGlyThrIleAsnPheTrpGl :  336
        |||||||||||||||  !|||||||||||||||!!!|||||||||||||||!:!||||||||
        PheThrPheGlySerThrPheLeuTyrSerGlyCysSerAspGlyThrIleSerPheTrpGl
  701 : TTTACTTTTGGTTCTACATTTCTCTACTCTGGCTGTTCAGACGGGACAATAAGCTTCTGGGA :  639

  337 : uArgGluArgThrSerTyrArgPheAsnHisGlyGlyPheLeuGlnGlyHisArgPheSerV :  357
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||!!.|||! !||||||||||||||||
        uArgGluArgThrSerTyrArgPheAsnHisGlyGlyLeuLeuLeuGlyHisArgPheSerV
  638 : AAGAGAGAGAACTTCTTACAGGTTCAACCATGGAGGGTTGTTACTAGGCCATAGATTCTCCG :  576

  358 : alLeuCysLeuValAlaValGluLysMetValPheSerGlySerGluAspThrThrIleArg :  377
        |||||||||||:!!|||||||||||||||||||||.!!||||||||||||||||||||||||
        alLeuCysLeuIleAlaValGluLysMetValPheGlyGlySerGluAspThrThrIleArg
  575 : TGCTTTGCCTCATTGCGGTGGAGAAGATGGTGTTCGGCGGTTCGGAAGATACAACGATTCGG :  516

  378 : IleTrpArgArgGluGluGlySerCysLeuHisGluCysLeuAlaValLeuAspGlyHisAr :  398
        |||||||||||||||||||||.!!|||!!!|||:!!||||||||||||||||||||||||||
        IleTrpArgArgGluGluGlyGlyCysPheHisLysCysLeuAlaValLeuAspGlyHisAr
  515 : ATATGGAGGAGAGAGGAAGGAGGATGTTTTCACAAGTGTCTGGCCGTGTTGGACGGGCACAG :  453

  399 : gGlyProValLys--CysLeuAlaAlaCysLeuGluValGluLysValValMetMetGlyPh :  418
        |            ##|||||||||||||||! !:!!|||||||||:!!||||||||||||||
        g------------##CysLeuAlaAlaCys***GlnValGluLysMetValMetMetGlyPh
  452 : A------------GGTGCTTAGCGGCGTGTTAGCAGGTCGAGAAAATGGTGATGATGGGGTT :  403

  419 : eLeuValTyrSerAlaSerLeuAspGlnThrPheLysValTrpArgValLysValLeuProA :  439
        ||||:!!||||||!.!|||||||||||||||!!.||||||||||||||||||:!!|||||||
        eLeuIleTyrSerValSerLeuAspGlnThrLeuLysValTrpArgValLysIleLeuProA
  402 : TCTGATTTACAGTGTGAGCTTGGACCAGACTTTGAAGGTCTGGAGAGTCAAAATCTTGCCTG :  340

  440 : spGluGlu :  441
        ||:!!|||
        spGlnGlu
  339 : ATCAAGAA :  332

-- completed exonerate analysis
