下载仓库内的pdb_index.html文件,传入代码中替换HTML_FILE_PATH,然后根据实际情况修改保存目录,最大连接数等参数,配置完成后使用python pdb_downloader.py即可启动下载。
python pdb_downloader.py
注:仓库内的pdb_index.html文件可能较老,无法包含pdb数据库中新上传的文件,该索引文件截止日期为2025-08-01,如需最新索引,请下载官方页面:https://files.pdbj.org/pub/pdb/data/structures/all/pdb/
特别声明: 截止到2025-08-01,PDB全库大约有70万个文件,全库下载耗时非常长,请酌情使用。另外,为了减轻数据库服务器的压力,请勿将并发数量设置过高。